Ya no recuerdo mucho sobre el fangame pero si mal no recuerdo la vez que me pasó lo mismo lo solucioné volando a otra ciudad. También puede intentar usar una cuerda de huida si te encuentras en una cueva, o la habilidad "Teletransportación" si posees un pokémon con esta habilidad.
Mmm... la única solución que se me ocurre sería probar cambiarte a una versión anterior haber si de alguna forma se te arregla el bug. Post: Descargar versiones anteriores de Pokémon Titán.